ที่เกาะเต่าเราสามารถเที่ยวชมดูแนวปะการังได้ง่ายๆจากการดำน้ำตื้น (สนอกเกิ้ล) และหลายๆที่สามารถลงไปได้จากชายหาด–ไม่ต้องนั่งเรือ ลักษณะของก้นทะเลที่เกาะเต่ามีความหลากหลาย มีทั้งเป็นพื้นทรายเรียบ และเป็นกองหินที่มียอดแหลม ซึ่งบ้างก็โผล่พ้นน้ำขึ้นมา บางจุดมีการซ้อนพิงกันของหินทำให้เกิดโพรงถ้ำเหมาะแก่การว่ายรอด (swimthrough) สำหรับนักดำน้ำที่มีประสบการณ์

ปะการังและสัตว์ทะเล

ปะการังและสัตว์ทะเลของเกาะเต่ามีความคล้ายคลึงกับที่พบในเขตร้อนทั่วโลก ความสมบูรณ์ของสัตว์ทะเลและพืชรอบๆเกาะเต่าเปรียบได้กับ ‘อควาเรี่ยม’ ตามธรรมชาติที่รอนักดำน้ำตื้นและนักดำน้ำสกูบาเข้ามาเยี่ยมชม ปลาสินสมุทรหลากสี (angelfish) ปลาผีเสื้อหลายชนิด (butterflyfish) และกระเบน มีอยู่มากมายตามแนวปะการัง ส่วนปะการังแข็งที่เกาะเต่า เช่น ปะการังเขากวาง ปะการังผักกาด ปะการังดอกไม้ ปะการังโขด ฯลฯ ก็มีความโดดเด่นมากในอ่าวไทย เกาะเต่าเป็นแหล่งดำน้ำที่เหมาะแก่การสังเกตและเรียนรู้ความสัมพันธ์อันซับซ้อนที่เกิดขึ้นในระบบนิเวศทางทะเล